Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS50Q96JG6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms