Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms