Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RP9Q8TA86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms