Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms