Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL3Q8N8U3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL3Q8N8U3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms