Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD35Q8N283 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD35Q8N283 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD35Q8N283 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD35Q8N283 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD35Q8N283 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD35Q8N283 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD35Q8N283 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD35Q8N283 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms