Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDXQ7Z353 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms