Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRCQ7RTU9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
STRCQ7RTU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms