Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK4Q6SA08 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms