Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EFCAB12Q6NXP0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EFCAB12Q6NXP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB12Q6NXP0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms