Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms