Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms