Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RRN3P1Q2M238 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RRN3P1Q2M238 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms