Protein–RNA interactions for Protein: Q16602

CALCRL, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRLQ16602 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCRLQ16602 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCRLQ16602 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCRLQ16602 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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