Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SHROOM2Q13796 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SHROOM2Q13796 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
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