Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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