Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNL1Q0VF96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CGNL1Q0VF96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNL1Q0VF96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms