Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCE1P61221 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms