Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00205P59089 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00205P59089 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms