Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A1P54219 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms