Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
IQGAP1P46940 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IQGAP1P46940 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IQGAP1P46940 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms