Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TSPAN7P41732 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms