Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGA1P17096 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms