Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBSP08397 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBSP08397 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBSP08397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HMBSP08397 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBSP08397 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBSP08397 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBSP08397 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBSP08397 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBSP08397 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBSP08397 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBSP08397 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBSP08397 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms