Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC2O95347 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC2O95347 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC2O95347 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC2O95347 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC2O95347 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC2O95347 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC2O95347 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC2O95347 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC2O95347 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC2O95347 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC2O95347 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC2O95347 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC2O95347 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC2O95347 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC2O95347 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms