Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3BO75182 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms