Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRNO43815 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRNO43815 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRNO43815 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRNO43815 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRNO43815 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRNO43815 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRNO43815 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRNO43815 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRNO43815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRNO43815 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRNO43815 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRNO43815 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRNO43815 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRNO43815 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRNO43815 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRNO43815 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRNO43815 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRNO43815 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRNO43815 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRNO43815 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRNO43815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRNO43815 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRNO43815 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRNO43815 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRNO43815 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms