Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms