Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK3BL2E5RIL1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK3BL2E5RIL1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms