Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms