Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGTLC3B5MD39 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGTLC3B5MD39 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms