Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARID3CA6NKF2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms