Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRK1Q8WUW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRK1Q8WUW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRK1Q8WUW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRK1Q8WUW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRK1Q8WUW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRK1Q8WUW1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms