Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALYREFQ86V81 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALYREFQ86V81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALYREFQ86V81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ALYREFQ86V81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALYREFQ86V81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALYREFQ86V81 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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