Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 CTSD-210ENST00000637381 374 ntTSL 513.1□□□□□ -0.314e-33■■■■■ 47.6
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SND1Q7KZF4 SLC2A6-203ENST00000414172 588 ntTSL 518■□□□□ 0.477e-13■■■■■ 47.5
SND1Q7KZF4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.44□□□□□ -0.17e-13■■■■■ 47.3
SND1Q7KZF4 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.58□□□□□ -0.567e-13■■■■■ 47.3
SND1Q7KZF4 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.57□□□□□ -0.567e-13■■■■■ 47.3
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SND1Q7KZF4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 47.3
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SND1Q7KZF4 STT3A-215ENST00000531599 973 ntTSL 311.5□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 46.8
SND1Q7KZF4 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 46.8
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SND1Q7KZF4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-23■■■■■ 46.7
SND1Q7KZF4 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-23■■■■■ 46.7
SND1Q7KZF4 RABAC1-203ENST00000596171 759 ntTSL 219.75■□□□□ 0.751e-14■■■■■ 46.7
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SND1Q7KZF4 LOX-204ENST00000508067 561 ntTSL 45.44□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 46.6
SND1Q7KZF4 AC012313.3-203ENST00000596636 436 ntTSL 514.63□□□□□ -0.071e-9■■■■■ 46.5
SND1Q7KZF4 CEMIP-206ENST00000560027 648 ntTSL 210.32□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 46.5
SND1Q7KZF4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-10■■■■■ 46.4
SND1Q7KZF4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.925e-12■■■■■ 46.3
SND1Q7KZF4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-12■■■■■ 46.3
SND1Q7KZF4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.098e-9■■■■■ 46
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SND1Q7KZF4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.918e-9■■■■■ 46
SND1Q7KZF4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 46
SND1Q7KZF4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.128e-9■■■■■ 46
SND1Q7KZF4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.138e-9■■■■■ 46
SND1Q7KZF4 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 513.47□□□□□ -0.258e-9■■■■■ 46
SND1Q7KZF4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 45.8
SND1Q7KZF4 SCAMP2-203ENST00000563663 1787 ntTSL 515.24■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 45.8
SND1Q7KZF4 SCAMP2-204ENST00000563829 3162 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 45.8
SND1Q7KZF4 SCAMP2-207ENST00000566480 2476 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 45.8
SND1Q7KZF4 SCAMP2-211ENST00000569251 867 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 45.8
SND1Q7KZF4 SCAMP2-212ENST00000569904 858 ntTSL 512.77□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 45.8
SND1Q7KZF4 ORM2-201ENST00000431067 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.548e-29■■■■■ 45.5
SND1Q7KZF4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 45.4
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SND1Q7KZF4 ALG8-203ENST00000524925 473 ntTSL 34.59□□□□□ -1.673e-12■■■■■ 45
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SND1Q7KZF4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.026e-15■■■■■ 44.6
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SND1Q7KZF4 OLFML3-201ENST00000320334 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.287e-10■■■■■ 43.8
SND1Q7KZF4 OLFML3-205ENST00000633022 495 ntTSL 48.82□□□□□ -17e-10■■■■■ 43.8
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SND1Q7KZF4 AGPAT5-206ENST00000533159 488 ntTSL 35.97□□□□□ -1.455e-12■■■■■ 43.8
SND1Q7KZF4 AGPAT5-207ENST00000533648 560 ntTSL 44.81□□□□□ -1.645e-12■■■■■ 43.8
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SND1Q7KZF4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 43.3
SND1Q7KZF4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 43.3
SND1Q7KZF4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.125e-47■■■■■ 43.3
SND1Q7KZF4 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.82□□□□□ -0.365e-47■■■■■ 43.3
SND1Q7KZF4 DKK1-202ENST00000467359 547 ntTSL 211.37□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 43
SND1Q7KZF4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 43
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SND1Q7KZF4 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 43
SND1Q7KZF4 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 43
SND1Q7KZF4 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 43
SND1Q7KZF4 CD74-209ENST00000523208 767 ntTSL 512.03□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 43
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SND1Q7KZF4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-17■■■■■ 42.9
SND1Q7KZF4 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 325.5■■□□□ 1.679e-9■■■■■ 42.9
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SND1Q7KZF4 C4A-251ENST00000470365 554 ntTSL 315.36■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 42.6
SND1Q7KZF4 BGN-202ENST00000431891 846 ntTSL 514.73□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 42.6
SND1Q7KZF4 C4A-244ENST00000460060 628 ntTSL 313.23□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 42.6
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