RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373970.3

DKK1-201, Transcript of dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DKK1, Length 1,790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1-201ENST00000373970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.82■■■■■ 4.45
DKK1-201ENST00000373970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.72■■■■□ 3.63
DKK1-201ENST00000373970 ABCC9O60706 1549 aa36.84■■■■□ 3.49
DKK1-201ENST00000373970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.97■■■■□ 3.35
DKK1-201ENST00000373970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
DKK1-201ENST00000373970 NACADO15069 1562 aa35.44■■■■□ 3.26
DKK1-201ENST00000373970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.41■■■■□ 3.26
DKK1-201ENST00000373970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.3■■■■□ 3.24
DKK1-201ENST00000373970 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.25■■■■□ 3.23
DKK1-201ENST00000373970 SCRIBQ14160 1630 aa34.71■■■■□ 3.15
DKK1-201ENST00000373970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.6■■■■□ 3.13
DKK1-201ENST00000373970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.59■■■■□ 3.13
DKK1-201ENST00000373970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.42■■■■□ 3.1
DKK1-201ENST00000373970 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.35■■■■□ 3.09
DKK1-201ENST00000373970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.49■■■□□ 2.95
DKK1-201ENST00000373970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
DKK1-201ENST00000373970 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.44■■■□□ 2.94
DKK1-201ENST00000373970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.22■■■□□ 2.91
DKK1-201ENST00000373970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
DKK1-201ENST00000373970 SMARCA4P51532 1647 aa33.12■■■□□ 2.89
DKK1-201ENST00000373970 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.09■■■□□ 2.89
DKK1-201ENST00000373970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.88■■■□□ 2.85
DKK1-201ENST00000373970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
DKK1-201ENST00000373970 SMARCA2P51531 1590 aa32.78■■■□□ 2.84
DKK1-201ENST00000373970 WIZO95785 1651 aa32.75■■■□□ 2.83
DKK1-201ENST00000373970 NCAPD3P42695 1498 aa32.74■■■□□ 2.83
DKK1-201ENST00000373970 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.7■■■□□ 2.82
DKK1-201ENST00000373970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
DKK1-201ENST00000373970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
DKK1-201ENST00000373970 HMGXB3Q12766 1538 aa32.57■■■□□ 2.8
DKK1-201ENST00000373970 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
DKK1-201ENST00000373970 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.05■■■□□ 2.72
DKK1-201ENST00000373970 NESP48681 1621 aa32■■■□□ 2.71
DKK1-201ENST00000373970 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.88■■■□□ 2.69
DKK1-201ENST00000373970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.78■■■□□ 2.68
DKK1-201ENST00000373970 CFTRP13569 1480 aa31.74■■■□□ 2.67
DKK1-201ENST00000373970 ERCC6Q03468 1493 aa31.69■■■□□ 2.66
DKK1-201ENST00000373970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.63■■■□□ 2.65
DKK1-201ENST00000373970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.54■■■□□ 2.64
DKK1-201ENST00000373970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.5■■■□□ 2.63
DKK1-201ENST00000373970 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.43■■■□□ 2.62
DKK1-201ENST00000373970 PRDM2Q13029 1718 aa31.36■■■□□ 2.61
DKK1-201ENST00000373970 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.28■■■□□ 2.6
DKK1-201ENST00000373970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
DKK1-201ENST00000373970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
DKK1-201ENST00000373970 WDR62O43379 1518 aa31.11■■■□□ 2.57
DKK1-201ENST00000373970 ABCC8Q09428 1581 aa31.07■■■□□ 2.57
DKK1-201ENST00000373970 TOPBP1Q92547 1522 aa31.05■■■□□ 2.56
DKK1-201ENST00000373970 CUX2O14529 1486 aa31.03■■■□□ 2.56
DKK1-201ENST00000373970 CUX1P39880 1505 aa30.99■■■□□ 2.55
DKK1-201ENST00000373970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.99■■■□□ 2.55
DKK1-201ENST00000373970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
DKK1-201ENST00000373970 SYNJ1O43426 1573 aa30.87■■■□□ 2.53
DKK1-201ENST00000373970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
DKK1-201ENST00000373970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.84■■■□□ 2.53
DKK1-201ENST00000373970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.78■■■□□ 2.52
DKK1-201ENST00000373970 TOP2BQ02880 1626 aa30.77■■■□□ 2.52
DKK1-201ENST00000373970 SOGA1O94964 1423 aa30.75■■■□□ 2.51
DKK1-201ENST00000373970 IFT140Q96RY7 1462 aa30.72■■■□□ 2.51
DKK1-201ENST00000373970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.72■■■□□ 2.51
DKK1-201ENST00000373970 TRIM41Q8WV44 630 aa30.66■■■□□ 2.5
DKK1-201ENST00000373970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
DKK1-201ENST00000373970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
DKK1-201ENST00000373970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
DKK1-201ENST00000373970 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
DKK1-201ENST00000373970 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.54■■■□□ 2.48
DKK1-201ENST00000373970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.48■■■□□ 2.47
DKK1-201ENST00000373970 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
DKK1-201ENST00000373970 WDR97A6NE52 1622 aa30.42■■■□□ 2.46
DKK1-201ENST00000373970 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.38■■■□□ 2.45
DKK1-201ENST00000373970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.3■■■□□ 2.44
DKK1-201ENST00000373970 GRIN2BQ13224 1484 aa30.28■■■□□ 2.44
DKK1-201ENST00000373970 KIF27Q86VH2 1401 aa30.27■■■□□ 2.44
DKK1-201ENST00000373970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.25■■■□□ 2.43
DKK1-201ENST00000373970 FBLN2P98095 1184 aa30.25■■■□□ 2.43
DKK1-201ENST00000373970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.24■■■□□ 2.43
DKK1-201ENST00000373970 PBRM1Q86U86 1689 aa30.19■■■□□ 2.42
DKK1-201ENST00000373970 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
DKK1-201ENST00000373970 IGF1RP08069 1367 aa30.13■■■□□ 2.41
DKK1-201ENST00000373970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
DKK1-201ENST00000373970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
DKK1-201ENST00000373970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.1■■■□□ 2.41
DKK1-201ENST00000373970 SYNJ2O15056 1496 aa30.03■■■□□ 2.4
DKK1-201ENST00000373970 ADAMTS12P58397 1594 aa30■■■□□ 2.39
DKK1-201ENST00000373970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30■■■□□ 2.39
DKK1-201ENST00000373970 OSCARQ8IYS5 282 aa29.98■■■□□ 2.39
DKK1-201ENST00000373970 CHD1O14646 1710 aa29.98■■■□□ 2.39
DKK1-201ENST00000373970 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.97■■■□□ 2.39
DKK1-201ENST00000373970 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.95■■■□□ 2.38
DKK1-201ENST00000373970 GRIN2AQ12879 1464 aa29.9■■■□□ 2.38
DKK1-201ENST00000373970 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.88■■■□□ 2.37
DKK1-201ENST00000373970 CUL7Q14999 1698 aa29.88■■■□□ 2.37
DKK1-201ENST00000373970 EEA1Q15075 1411 aa29.87■■■□□ 2.37
DKK1-201ENST00000373970 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.79■■■□□ 2.36
DKK1-201ENST00000373970 PRXQ9BXM0 1461 aa29.77■■■□□ 2.36
DKK1-201ENST00000373970 CEP170Q5SW79 1584 aa29.74■■■□□ 2.35
DKK1-201ENST00000373970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.72■■■□□ 2.35
DKK1-201ENST00000373970 NUP160Q12769 1436 aa29.71■■■□□ 2.35
DKK1-201ENST00000373970 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.64■■■□□ 2.33
DKK1-201ENST00000373970 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms