RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.07■■■■□ 3.52
SSR4-209ENST00000482902 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.61■■■□□ 2.65
SSR4-209ENST00000482902 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.47■■■□□ 2.63
SSR4-209ENST00000482902 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
SSR4-209ENST00000482902 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SSR4-209ENST00000482902 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.71■■■□□ 2.51
SSR4-209ENST00000482902 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.43■■■□□ 2.46
SSR4-209ENST00000482902 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.22■■■□□ 2.43
SSR4-209ENST00000482902 HRCP23327 699 aa30.18■■■□□ 2.42
SSR4-209ENST00000482902 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.08■■■□□ 2.41
SSR4-209ENST00000482902 ABCC9O60706 1549 aa29.6■■■□□ 2.33
SSR4-209ENST00000482902 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.52■■■□□ 2.32
SSR4-209ENST00000482902 SCRIBQ14160 1630 aa29.5■■■□□ 2.31
SSR4-209ENST00000482902 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SSR4-209ENST00000482902 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SSR4-209ENST00000482902 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.31■■■□□ 2.28
SSR4-209ENST00000482902 NACADO15069 1562 aa29.11■■■□□ 2.25
SSR4-209ENST00000482902 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.04■■■□□ 2.24
SSR4-209ENST00000482902 TRIM41Q8WV44 630 aa28.93■■■□□ 2.22
SSR4-209ENST00000482902 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.9■■■□□ 2.22
SSR4-209ENST00000482902 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SSR4-209ENST00000482902 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.81■■■□□ 2.2
SSR4-209ENST00000482902 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SSR4-209ENST00000482902 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SSR4-209ENST00000482902 WIZO95785 1651 aa28.64■■■□□ 2.18
SSR4-209ENST00000482902 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SSR4-209ENST00000482902 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SSR4-209ENST00000482902 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SSR4-209ENST00000482902 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.41■■■□□ 2.14
SSR4-209ENST00000482902 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SSR4-209ENST00000482902 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
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SSR4-209ENST00000482902 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.12■■■□□ 2.09
SSR4-209ENST00000482902 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.11■■■□□ 2.09
SSR4-209ENST00000482902 SMARCA2P51531 1590 aa28.06■■■□□ 2.08
SSR4-209ENST00000482902 ABCC8Q09428 1581 aa28.02■■■□□ 2.08
SSR4-209ENST00000482902 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
SSR4-209ENST00000482902 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.83■■■□□ 2.05
SSR4-209ENST00000482902 SOGA1O94964 1423 aa27.79■■■□□ 2.04
SSR4-209ENST00000482902 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SSR4-209ENST00000482902 EEA1Q15075 1411 aa27.7■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 CEP162Q5TB80 1403 aa27.7■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 NEUROD1Q13562 356 aa27.69■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.67■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.67■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 MYT1Q01538 1121 aa27.67■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.67■■■□□ 2.02
SSR4-209ENST00000482902 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.64■■■□□ 2.01
SSR4-209ENST00000482902 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
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SSR4-209ENST00000482902 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SSR4-209ENST00000482902 GOLGA3Q08378 1498 aa27.5■■□□□ 1.99
SSR4-209ENST00000482902 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
SSR4-209ENST00000482902 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.49■■□□□ 1.99
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SSR4-209ENST00000482902 SYNJ1O43426 1573 aa27.42■■□□□ 1.98
SSR4-209ENST00000482902 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
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SSR4-209ENST00000482902 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.11■■□□□ 1.93
SSR4-209ENST00000482902 TOP2BQ02880 1626 aa27.09■■□□□ 1.93
SSR4-209ENST00000482902 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.07■■□□□ 1.92
SSR4-209ENST00000482902 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.98■■□□□ 1.91
SSR4-209ENST00000482902 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SSR4-209ENST00000482902 APLP2Q06481 763 aa26.97■■□□□ 1.91
SSR4-209ENST00000482902 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SSR4-209ENST00000482902 NCAPD3P42695 1498 aa26.95■■□□□ 1.9
SSR4-209ENST00000482902 HMGXB3Q12766 1538 aa26.94■■□□□ 1.9
SSR4-209ENST00000482902 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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SSR4-209ENST00000482902 CUX1P39880 1505 aa26.82■■□□□ 1.88
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SSR4-209ENST00000482902 KIF27Q86VH2 1401 aa26.74■■□□□ 1.87
SSR4-209ENST00000482902 ARAP1Q96P48 1450 aa26.73■■□□□ 1.87
SSR4-209ENST00000482902 MIER1Q8N108 512 aa26.69■■□□□ 1.86
SSR4-209ENST00000482902 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SSR4-209ENST00000482902 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.49■■□□□ 1.83
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SSR4-209ENST00000482902 CUX2O14529 1486 aa26.46■■□□□ 1.83
SSR4-209ENST00000482902 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.46■■□□□ 1.83
SSR4-209ENST00000482902 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
SSR4-209ENST00000482902 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
SSR4-209ENST00000482902 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.45■■□□□ 1.82
SSR4-209ENST00000482902 IGF1RP08069 1367 aa26.43■■□□□ 1.82
SSR4-209ENST00000482902 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.35■■□□□ 1.81
SSR4-209ENST00000482902 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.34■■□□□ 1.81
SSR4-209ENST00000482902 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.33■■□□□ 1.81
SSR4-209ENST00000482902 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SSR4-209ENST00000482902 ITGAEP38570 1179 aa26.23■■□□□ 1.79
SSR4-209ENST00000482902 TIAM1Q13009 1591 aa26.21■■□□□ 1.79
SSR4-209ENST00000482902 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.21■■□□□ 1.79
SSR4-209ENST00000482902 MAP3K1Q13233 1512 aa26.21■■□□□ 1.79
SSR4-209ENST00000482902 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.19■■□□□ 1.78
SSR4-209ENST00000482902 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.12■■□□□ 1.77
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