Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZFHX3Q15911 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFHX3Q15911 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFHX3Q15911 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFHX3Q15911 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFHX3Q15911 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFHX3Q15911 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFHX3Q15911 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFHX3Q15911 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFHX3Q15911 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFHX3Q15911 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFHX3Q15911 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFHX3Q15911 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFHX3Q15911 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFHX3Q15911 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFHX3Q15911 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFHX3Q15911 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFHX3Q15911 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFHX3Q15911 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFHX3Q15911 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFHX3Q15911 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFHX3Q15911 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFHX3Q15911 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFHX3Q15911 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFHX3Q15911 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
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