Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4BO94953 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM4BO94953 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4BO94953 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4BO94953 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM4BO94953 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM4BO94953 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4BO94953 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM4BO94953 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4BO94953 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM4BO94953 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM4BO94953 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4BO94953 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4BO94953 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms