Protein–RNA interactions for Protein: A6NED7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NED7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NED7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NED7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NED7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NED7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NED7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NED7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NED7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NED7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NED7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NED7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A6NED7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NED7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NED7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A6NED7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NED7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A6NED7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NED7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NED7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NED7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NED7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NED7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NED7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NED7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NED7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NED7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NED7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NED7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NED7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NED7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NED7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A6NED7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A6NED7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A6NED7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A6NED7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A6NED7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A6NED7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A6NED7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A6NED7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A6NED7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A6NED7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A6NED7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A6NED7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A6NED7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A6NED7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A6NED7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NED7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NED7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NED7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NED7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NED7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NED7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NED7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NED7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NED7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NED7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NED7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NED7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NED7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NED7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NED7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NED7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NED7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A6NED7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A6NED7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NED7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NED7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NED7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NED7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NED7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NED7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NED7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NED7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NED7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NED7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NED7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NED7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NED7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NED7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NED7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NED7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NED7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NED7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A6NED7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NED7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NED7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NED7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NED7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NED7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NED7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NED7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NED7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NED7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NED7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A6NED7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A6NED7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A6NED7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A6NED7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A6NED7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A6NED7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms