Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSL6Q9UKU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL6Q9UKU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms