Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms