Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms