Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF3BQ9BZI7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms