Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG6Q9BXT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG6Q9BXT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG6Q9BXT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG6Q9BXT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG6Q9BXT2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG6Q9BXT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG6Q9BXT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG6Q9BXT2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms