Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXRA8Q9BRK3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MXRA8Q9BRK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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