Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GORASP1Q9BQQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms