Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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