Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMD3Q96D46 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMD3Q96D46 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms