Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms